AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel ― это таргетная панель для изучения экзонов 409 известных генов, ассоциируемых с раком. Основные характеристики:
Содержимое набора
Предназначен для изучения 409 генов, связанных с раком.
Быстрый, оптимизированный рабочий процесс
Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE
Точные данные
Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis
Панель Comprehensive Cancer является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.
Эта панель обнаруживает вариации в генах. ассоциируемых с несколькими типами рака, включая раки легких, толстой кишки, молочной железы, яичников, предстательной железы, меланомы и с гематологическими злокачественными опухолями. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.
Спецификации
| Число ампликонов |
всего 15,992. 4 пула. (Пул 1: 3,996 ампликонов. Пул 2: 4,008 ампликонов. Пул 3: 3,991 ампликонов. Пул 4: 3,997 ампликонов) |
|---|---|
|
Время анализа |
6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) |
|
Время ручного труда |
<1,5 часа |
| Тип нуклеиновой кислоты | ДНК |
| Количество стартового материала | 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул) |
| Особенности содержимого |
Полное покрытие экзоном 409 генов, связанных с раком |
| Multiplexing | 96 dual index combinations |
|
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
| Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
| Класс вариаций |
Copy Number Variants (CNVs), Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants |
| Для работы с какими платформами подходит |
NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме) |
| Специальные типы образцов | кровь, FFPE |
| Технология | Секвенирование |